Сегодня Атлантический филиал федерального государственного бюджетного научного учреждения "Всероссийский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии" - ведущий научно-исследовательский институт России по изучению сырьевой базы рыболовства в Балтийском море, Атлантическом океане, Юго-Восточной части Тихого и Западной части Индийского океанов. Цель исследований института - создание научных основ рациональной эксплуатации биоресурсов и эффективного их использования на базе современных технологий.
Научно-исследовательская деятельность института осуществляется в двух направлениях: биологическом и технологическом. В состав биологического направления входят подразделения, специалисты которых исследуют эксплуатируемые и перспективные объекты рыболовства, изучают среду их обитания. Институт участвует в программах международных организаций ФАО, НАФО, ИКЕС, АНТКОМ, ИККАТ, СПРФМО и др.